室管膜瘤是发生在儿童和成人中枢神经系统（CNS）的神经上皮恶性肿瘤，常见发生于幕上、颅后窝和脊髓位置。与脑部室管膜瘤多发生于儿童不同，脊髓室管膜瘤多见于成人。手术切除是目前脊髓室管膜瘤的主要治疗方法，但不是所有病人均具备全切除手术条件。对于不接受辅助放化治疗的次切除患者，肿瘤复发率高达50%-70%。因此，发现新型治疗靶点和治疗策略对于临床室管膜瘤的治疗有重要意义。
近日，北京师范大学教授吴倩课题组联合中国科学院生物物理研究所研究员王晓群医院主任贾文清团队，在NatureCommunications上发表了题为Interrogationofthemicroenvironmentallandscapeinspinalependymomasrevealsdualfunctionsoftumor-associatedmacrophages的研究论文。该工作在单细胞水平对脊髓室管膜瘤中的恶性细胞、免疫和基质细胞开展了系统性研究，揭示了肿瘤微环境的细胞类群和基因表达谱，深入解析了肿瘤相关巨噬细胞亚群的分子特征、谱系转化特点及这些免疫细胞与其他细胞间的互作关系。
过去十余年中，单细胞水平的基因组学，转录组学和表观遗传组学技术被广泛应用到肿瘤细胞和肿瘤微环境异质性研究中，但是对于成人脊髓室管膜瘤，尤其是室管膜瘤的细胞组成和微环境特点的研究十分有限。该文章对三种恶性程度不同的脊髓室管膜瘤subependymoma(SE)，ependymoma(EPN)和anaplasticependymoma(AEP)进行了多组学的测序分析，包括单细胞RNA-seq、单细胞ATAC-seq和H3K4me3/H3K27acChIP-seq，得到脊髓室管膜瘤恶性细胞和肿瘤微环境的细胞图谱和表观遗传信息。
研究重点